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MassARRAY核酸质谱基因分型检测

Agena Bioscience公司推出的MassARRAY系统是直接检测核酸的桌面式质谱仪。MassARRAY系统,主要是针对检测DNA靶标数量需求在十几个到几百个位点,可实现中通量,低成本,短周期,高精准的基因分型。其实验操作和数据分析简单,目前可检测的变异类型包括:点突变、插入/缺失、拷贝数变异、基因融合、甲基化。应用范围覆盖药物基因组学、遗传性疾病、肿瘤及液体活检、传染性疾病等各个领域。

  • 通过多重PCR,扩增出含有检测靶标的DNA序列,目前我们一个孔可以做到40重PCR反应,即在一个孔里,我们可以检测40个靶标位点。

  • 通过iPLEX技术进行单碱基延伸,针对某一个检测靶标,由于我们的延伸引物序列是一样的,所以针对该检测靶标,只有延伸的末端目标碱基一个碱基的差异。后续我们就是根据末端目标碱基的质量差来进行基因分型的。

  • 将单碱基延伸后的产物进行纯化,然后移到SpectroCHIP芯片上,进行质谱检测。打质谱的原理如下图所示,DNA被激光照射带正电,在检测的真空管中飞行,飞行速度与各个延伸产物的质量成反比,最后通过出峰的位置,判定碱基类型,从而实现基因分型。

MassARRAY系统检测结果

MassARRAY系统检测原理

MassARRAY系统检测基因分型的核心原理是多重PCR+单碱基延伸+质谱飞行检测,最终由于不同碱基的分子质量差,导致其在质谱飞行的过程中,分子质量大的飞行速度慢,最后根据出峰的位置,判断碱基类型。

MassARRAY系统的检测结果会给出直接的峰图,一目了然的判定检测靶标的基因型,结果精确,稳定。如下图所示,杂合SNP由于G,T碱基的质量差,会产生两个峰,而纯合的SNP,就只有一个峰。我们根据不同碱基的质量差,来判定该峰的碱基类型。

MassARRAY系统主要应用领域

*本服务仅限科研使用,不可用于临床诊断流程

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