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Nat Commun.| 清华大学携手协和医学院肿瘤医院应用单细胞转录组测序联合多重荧光免疫组化技术发现胃癌中T细胞耗竭新路径
清华大学蓝勋团队与中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院胰胃外科田艳涛团队合作，于去年8月在《Nature Communications》上发表的题为“scRNA-seq of gastric tumor shows complex intercellular interaction with an alternative T cell exhaustion trajectory”的研究成果，通过应用单细胞转录组测序（sc-RNASeq）结合PhenoImager多重荧光免疫组化技术（mIHC），绘制了胃癌患者肿瘤组织、癌旁正常组织和匹配的外周血中免疫细胞、基质细胞和上皮细胞的表达图谱，并结合T细胞受体（TCR/BCR）进行全谱分析。该研究发现了胃癌肿瘤微环境中新的T细胞耗竭路径，并预测其作为胃癌靶向治疗靶点的可能。
2023-05-30
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Sci Adv | PhenoCycler 52个超多蛋白靶标建立溃疡性肠炎空间图谱，发现预测患者治疗响应性指标
溃疡性结肠炎（Ulcerative colitis，UC）研究领域又有新进展！近日，斯坦福医学院的Stephan Rogalla研究团队在《Science Advances》（IF=14.957）杂志上发表了题为“溃疡性结肠炎组织图谱揭示疾病驱动的炎症细胞类型及其对 TNF 抑制剂治疗耐药性的性别差异（A tissue atlas of ulcerative colitis revealing evidence of sex-dependent differences in disease-driving inflammatory cell types and resistance to TNF inhibitor therapy ）”的文章，作者通过对UC患者临床活检样本的52个蛋白标志物成像+空间邻域分析，建立了UC组织微环境的空间图谱并总结了TNF抑制剂治疗导致炎症细胞邻域变化的规律，进而给出通过空间蛋白组学方法进行UC患者治疗响应程度预测的建议方案[1]。
2023-05-30
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Nature | 单细胞及空间多组学构建孕早期滋养层发育的空间多组学图谱
在胎盘的发育过程中，滋养层细胞（trophoblast）会通过子宫壁迁移，改变母体血管以建立氧气和营养物的供应线，这个过程对于胎盘的形成和嵌入子宫，以及最终是否成功妊娠至关重要。近日，来自英国剑桥大学等机构的研究人员在Nature上发表了一篇题为“Spatial multiomics map of trophoblast development in early pregnancy”的报告，为我们揭开了人类孕早期母胎界面的空间分辨单细胞多组学特征的神秘面纱。
2023-05-30
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Nature | 北大团队应用10x单细胞及空间转录组 超多色免疫荧光解析肝癌免疫微环境
2022年11月9日，北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁团队与北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）张泽民团队、北京大学人民医院肝胆外科朱继业团队紧密合作，在Nature发表了题为Liver tumor immune microenvironment subtypes and neutrophil heterogeneity 的研究论文，揭示了肝癌免疫微环境亚型和中性粒细胞异质性。
2023-05-30
