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Nature genetics | 单细胞 空间多组学解析H3-K27M突变驱动胶质瘤细胞状态和空间景观
2022年12月，美国麻省理工大学Ilon Liu和Mariella G. Filbin教授通过解析H3-K27M突变体弥漫性中线胶质瘤患者的单细胞转录组、表观基因组和空间结构，描述了年龄和解剖位置如何在共同的K27M 驱动突变的条件下塑造胶质瘤细胞的内外特征。
2023-03-29
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Adv Sci(IF=17.52) | 郑州大学第一附属医院秦艳茹/香港大学关新元团队多组学技术揭示食管鳞癌转移微环境
近日，郑州大学第一附属医院肿瘤科秦艳茹主任团队与香港大学癌症研究中心关新元教授团队联合在《Advanced Science》（IF=17.521）杂志上发表了题为“Single-Cell Transcriptomic Analysis of Primary and Metastatic Tumor Ecosystems in Esophageal Squamous Cell Carcinoma" 的研究成果，通过利用多组学方法揭示转移性食管鳞状细胞癌(ESCC)微环境的细胞间相互作用与原发肿瘤的差异，展现了形成淋巴结转移微环境的潜在分子机制，为药物研究和新治疗方案的开发提供了新的思路[1]。
2023-03-29
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CNS热点 | 单细胞多组学scRNA-seq scATAC-seq研究思路解析
单细胞多组学研究方案可以从单个细胞中获取更多信息，发现隐藏的线索，加深对生物学的理解。10x单细胞多组学ATAC + 10x基因表达研究方案（scATAC-seq+scRNA-seq），可通过一个简单的流程将同一单细胞的基因表达和ATAC-seq数据相整合，获得转录图谱和染色质景观的一体化视图。以单细胞核悬液作为起始样本，对大量细胞核进行转座，之后将单个细胞核捕获在GEM中，其中DNA片段和mRNA的3’端都带有条形码。从每个样本生成两个互补的文库，将基因表达和开放染色质图谱明确地链接回同一细胞。
2023-03-29
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开发空间特征标志物，与不断变化的精准治疗格局保持同步
我们使用术语“癌症”作为通用的描述，而实际上我们可以分类的癌症有200多种。癌症在哪里发生，何时发生，以及在诊断之前能够折磨一个人多长时间都是关键因素，每个因素都对预后和病理学产生巨大影响。癌症治疗也是如此，治疗方案可以对一个人非常有效，然后对其他人完全无效。这一现实有时可能非常令人沮丧，并说明了为什么迫切需要发现更精确地解决这个问题的新方法。
2023-03-29
