单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究细胞异质性的可靠技术,自2009年推出后,在医学、动植物等多个领域得到应用。今年年初,10x Genomics公司推出了升级版的GEM-X技术,它通过改进试剂和芯片设计以及升级配套分析软件,大幅提升了10x技术的单细胞检测性能。更高的单细胞通量,更高的捕获率,更高的基因检出灵敏度,更低的多胞率,让人眼前一亮!
图:利用GEM-X芯片流程生成GEM和添加条形码的示意图
最近,10x又推出了GEM-X Flex单细胞解决方案,可以兼容多聚甲醛(PFA)固定样本以及FFPE样本,并且可以实现混样检测,一个通道可以混16个样本检测32万个细胞,一次上机8个通道最多可以检测128个样本捕获256万个细胞!
图:GEM-X Flex基因表达分析工作流程
技术优势
4. 更高的数据质量和稳定性:多胞率减半(每1000个细胞为0.4%),GEM生成更高效,同时减少应激反应;
5. 提升免疫细胞全长VDJ序列的配对率:提升免疫组库的复杂性;
6,GEM-X Flex单细胞解决方案,可以兼容新鲜或PFA固定的组织、细胞、细胞核及FFPE等样本;
7,GEM-X Flex单细胞解决方案,可混样:每个通道可混合多达16个样本和32万个细胞;每次运行可分析多达128个样本和256万个细胞。
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