【Xenium 5K 空间原位检测】云准实测数据来啦！！！

Xenium多模态细胞分割，染色原理利用多种形态特征( 细胞膜、细胞核、细胞质染色）+ 神经网络算法识别，对样本细胞边界及进行分割，实现更精准的转录本到细胞的分配。Xenium 5K panel （人和小鼠）设计是从已发表的单细胞组织特异性图谱和客户输入中选择多达5,000个基因的空间定位信息以及高达100个基因的个性化定制，涵盖100+药物靶点、2500+信号通路基因、细胞类型marker、细胞间通讯Marker等基因，使得其在细胞类型鉴定、信号通路研究、生物标志物筛选和细胞互作的探索达到了全新的水平。

云准Xenium 5K 实测数据展示（TMA样本）

接下来，将展示Xenium-5K下机得到的web summary人-癌症-头颈鳞癌-TMA1样本数据的质控报告，一起感受Xenium Prime 5K panel 的具体表现吧！

人-癌症-头颈鳞癌-TMA1样本

图1.人-癌症-头颈鳞癌-TMA1的关键指标

图2.基因特异性转录本质量，设计加入了阴性对照探针和基因组对照探针，Panel中的基因的转录计数和平均质量均高于阴性对照

图3.Panel中每个基因的高质量转录本计数

图4.细胞分割的指标（左图）、分割方法（右图）

图5.样本中大部分区域每7.5-147.5um2捕获细胞数＞10k（左图）、每个细胞中检测到的基因数（中图）、每个细胞检测到的转录本数（右图）

图6.切片原位捕获的转录本热图（左上）、转录本计数的UMAP热图（右上）、切片上细胞的聚类图（左下）、UMAP聚类图（右下）

图7.人-癌症-头颈鳞癌-TMA1多种形态染色质控图，利用多种形态特征（细胞核、细胞膜和细胞质）对细胞进行精准分割

通过云准实测的 Xenium 5K 数据，得到了高质量的数据质控、高密度的基因分布、精准的细胞分割和清晰的细胞定位分群。通过最直观的总体的质控，有利于我们对数据的总体把控。除了组织芯片（TMA）样本，Xenium兼容多种组织类型，如新鲜冷冻（FF）、福尔马林固定石蜡包埋（FFPE），在亚细胞水平上还原组织微环境形态结构，为病理结构和细胞功能研究提供新见解。Xenium 5K 数据的检测得到了老师们的高度认可，可以进一步深入挖掘 Xenium 5K 数据中的信息，解决实际的科学问题。

文案：李秋燕

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