云准服务|核酸质谱基因分型检测服务

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MassARRAY系统可以直接检测核酸的桌面式质谱仪。MassARRAY系统,主要是针对检测DNA靶标数量需求在十几个到几百个位点,可实现中通量,低成本,短周期,高精准的基因分型。应用范围覆盖药物基因组学、遗传性疾病、肿瘤及液体活检、传染性疾病等各个领域。

 

 

MassARRAY系统检测基因分型的核心原理是多重PCR+单碱基延伸+质谱飞行检测,最终由于不同碱基的分子质量差,导致其在质谱飞行的过程中,分子质量大的飞行速度慢,最后根据出峰的位置,判断碱基类型。

 

 

1.首先,我们会通过多重PCR,扩增出含有检测靶标的DNA序列,目前我们一个孔可以最多做40重PCR反应,即在一个孔里,我们可以最多检测40个靶标位点。

 

2.随后,我们会通过iPLEX技术进行单碱基延伸,针对某一个检测靶标,由于我们的延伸引物序列是一样的,所以针对该检测靶标,只有延伸的末端目标碱基一个碱基的差异。后续我们就是根据末端目标碱基的质量差来进行基因分型的。

 

 

 

3.接下来,我们就可以将单碱基延伸后的产物进行纯化,然后移到SpectroCHIP芯片上,进行质谱检测。打质谱的原理如下图所示,DNA被激光照射带正电,在检测的真空管中飞行,飞行速度与各个延伸产物的质量成反比,最后通过出峰的位置,判定碱基类型,从而实现基因分型。

 

 

 

 


 

 

MassARRAY系统检测结果

 

MassARRAY系统的检测结果会给出直接的峰图,一目了然的判定检测靶标的基因型,结果精确,稳定。如下图所示,杂合SNP由于G,T碱基的质量差,会产生两个峰,而纯合的SNP,就只有一个峰。我们根据不同碱基的质量差,来判定该峰的碱基类型。

 

 

 


 

 

MassARRAY系统主要应用领域

 

 

 


 

 

MassARRAY系统主要服务项目

 

   肿瘤变异检测   

包括肺癌,结直肠癌,黑色素瘤,胰腺癌,宫颈癌,胶质瘤等,

更多癌种请咨询我们!

 

 

 

 

 

   遗传病筛查   

如先天性耳聋,地中海贫血,囊性纤维化等,

更多遗传病筛查请咨询我们!

 

 

 

 

   用药指导   

高血压用药基因检测;糖尿病用药基因检测;

降脂常用药基因检测;抗凝抗栓药基因检测;

慢性病常用药基因检测;精神疾病用药指导;

风湿及通风用药基因检测;儿童用药安全基因检测;

营养吸收能力基因检测等。

 

 

 

 

   病原微生物检测   

30种人乳头瘤病毒双基因检测;

13种人多瘤病毒检测方法;

18种手足口病相关病毒检测方法;

21种常见呼吸道病毒检测方法;冠状病毒多基因检测方法;

SARS-COV-2新冠肺炎检测!

 

 

 

 

   农业遗传分析   

家畜亲缘鉴定;候选分子标记验证;作物种系验证;

QTL检测;分子标记辅助育种;基因型筛选。

 

 

 

   甲基化检测   

现有panel检测与胶质瘤和胶质母细胞瘤相关的MGMT启动子区域的甲基化变化,

检测与林奇综合症相关的MLH1基因甲基化变化,以及对目标区域进行定制甲基化变异检测。

 

 

 

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