KREX® 技术赋能自身抗体精准发现：系统性红斑狼疮新型 IgG/IgA 自身抗体的鉴定及其诊断标志物价值

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文章题目：针对 DNA 结合和 RNA 结合蛋白的新 IgG 和 IgA 自身抗体特异性将系统性红斑狼疮与健康和非狼疮自身免疫区分开来——抗 LIN28A 可以提高诊断的精度吗？

发表期刊：Annals of the rheumatic diseases

影响因子：20.3

发表时间：2025-05-14

发表单位：瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡医学院索尔纳医学系和卡罗林斯卡大学医院风湿病科;瑞典斯德哥尔摩分子医学中心

背景

系统性红斑狼疮（SLE）的特征是大量产生自身抗体，但许多系统的临床效用仍不清楚，并且一些特异性尚未完全表征。当前 SLE 的诊断依赖于自身抗体检测，但传统指标如抗双链 DNA（抗 dsDNA）和抗核抗体（ANA）存在明显局限性 ——ANA 虽对自身免疫病敏感性高，但缺乏特异性；抗 dsDNA 等抗体特异性高，却敏感性不足。此外，SLE 患者中存在大量未被充分表征的自身抗体，尤其是 IgA 类抗体的临床意义尚未明确，亟需更精准的生物标志物以优化诊断和分子分型。在此背景下，研究团队旨在通过高通量技术筛选并验证新型 IgG 和 IgA 自身抗体，以提升 SLE 诊断的准确性和特异性。

实验设计

平台和实验设计：

平台：研究采用Sengenics 公司的 i-Ome Discovery 蛋白质微阵列平台，基于 KoRectly EXpressed（KREX）技术构建。该平台可展示 1609 种全长、正确折叠的人类蛋白质，保留天然三维结构和构象表位，确保抗体 - 抗原结合的生物学相关性。

实验设计：研究包括两个独立的队列——发现队列和验证队列，涵盖了SLE患者、原发性干燥综合征（SjD）、系统性硬化症（SSc）患者以及健康对照组（HCs）。发现队列用于识别潜在的自身抗体，而验证队列用于验证这些自身抗体的特异性和敏感性。

队列设计：

发现队列（横断面）：

SLE患者（n=199）

原发性干燥综合征（SjD, n=115）

系统性硬化症（SSc, n=115）

健康对照（HCs, n=111）

验证队列（纵向）：

新诊断SLE患者（n=30，基线（诊断后1年内）6个月和14个月随访）

SjD（n=31）, SSc（n=24）, HCs（n=84）

图1：研究分析流程和主要发现

研究结果

一、差异自身抗体（daAAb）筛选与验证

作者在发现队列中发现 SLE 与 HC 中有 27 个 IgG daAAb 升高（图 2A），其中 25 个在验证队列中得到确认（图 2D），SLE 与 SjD 中 18 个 IgG daAAb 升高（图 2B），其中 16 个得到验证（图 2E，G），以及 SLE 与 SSc 中 18 个升高的 IgG daAAbs（图 2C），其中 17 个得到验证（图 2F，G）。同样，作者在发现队列中发现 SLE 与 HC 中有 21 个 IgA daAAb 升高（图 3A），其中 18 个得到验证（图 3D，G），SLE 与 SjD 中 14 个 IgA daAAbs 升高和 1 个 IgA daAAbs 降低（图 3B），其中 8 种升高的 IgG daAAb 得到验证（图 3E、G），以及 SLE 与 SSc 中 19 个 IgG daAAb 升高（图 3C），其中 18 个得到验证（图 3F，G）。

作者进一步分析了在所有三组比较中（SLE vs HC，SLE vs SjD，SLE vs SSc）持续显著升高的IgG和IgA自身抗体水平。在发现队列中，7种IgG daAAbs(anti−Lin-28 homolog A [LIN28A], anti-HNRNPA2B1, anti-HMG20B, anti-HMGB2, anti-TGIF2, anti-NFIA, and anti-alpha-globin transcription factor CP2 [TFCP2])和14种IgAdaAAbs (anti-LIN28A, anti-HMG20B, anti-HMGB2, anti-SUB1, anti-PCBP2, anti-NRF1, anti-TFCP2, anti-MAZ, anti-ZSCAN26, anti-TGIF2, anti-HMGN5, anti-NFIA, anti-NOL4, and anti-PSIP1)自身抗体在SLE患者中水平更高，这些结果在验证队列中得到了确认，表明这些抗体可能有助于SLE的诊断和区分。

图2. SLE vs HC、SjD 和 SSc 中的 IgG daAAbs

图3. .SLE vs HC、SjD 和 SSc 中的 IgA daAAbs

二、新型自身抗体的诊断效能评估
（图4）主要呈现了新型 IgG 和 IgA 自身抗体在系统性红斑狼疮（SLE）中的诊断效能及与传统抗体的对比。在 IgG 抗体中，17 种差异自身抗体（daAAb）对 SLE 特异性达 87%~98%，如抗 LIN28A 在验证队列中特异性 89%、敏感性 69%，准确性 86%，显著优于传统抗 dsDNA 抗体（敏感性 31%）。IgA 抗体中，21 种 daAAb 特异性 91%~96%，抗 LIN28A 和 HMGB2 在验证队列中准确性分别为 87% 和 87%，提示黏膜免疫的潜在作用。传统抗体如抗 Sm 敏感性仅 4%，诊断局限性显著。此外，新型抗体如抗 LIN28A 与抗染色质抗体呈强相关性（R=0.63，P<0.001），暗示其参与 SLE 染色质免疫异常机制。综上，新型 IgG 和 IgA 抗体在 SLE 诊断中展现出更高的敏感性和特异性，为精准诊断提供了新依据。

图4. IgG 和 IgA daAAb 以及常规自身抗体在 SLE 中针对 HC、SjD 和 SSc 的联合诊断性能以及与 IgG 抗染色质的相关性

三、自身抗体的动态变化与临床意义

IgG自身抗体：（图5A）展示了在SLE患者中，IgG自身抗体水平在14个月随访期间的变化。IgG抗LIN28A、IgG抗HMG20B和IgG抗TFCP2的水平随时间显著下降，而IgG抗HNRNPA2B1、IgG抗HMGB2和IgG抗NFIA的水平则没有显著变化。这些数据表明，某些IgG自身抗体水平的变化可能与疾病活动性的变化有关。

IgA自身抗体：同样，（图5B）展示了在SLE患者中，IgA自身抗体水平在14个月随访期间的变化。IgA抗LIN28A、IgA抗SUB1、IgA抗PCBP2和IgA抗TGIF2的水平随时间显著下降，而IgA抗HMG20B、IgA抗HMGB2、IgA抗NRF1、IgA抗MAZ、IgA抗HMGN5、IgA抗NFIA、IgA抗NOL4和IgA抗PSIP1的水平则没有显著变化。这些发现表明，某些自身抗体的水平可能随疾病活动性而变化，有助于监测SLE的病程。

图5.SLE病程中IgG和IgA daAAb水平的变化

四、患者亚群分型与靶抗原功能

患者亚组聚类分析：作者通过聚类分析，根据SLE患者对多种蛋白抗原的IgG和IgA自身抗体（daAAbs）阳性状态，将患者分为不同的反应组。（图6A和图6B）所示，SLE患者中有一组对多种抗原表现出IgG反应性，其他三组表现出不同程度的反应性，还有一组无反应性。IgG daAAbs被分为三个不同的簇，IgA daAAbs同样被分为三个簇。传统自身抗体在各患者亚组中普遍存在，特别是多反应性亚组中抗核小体抗体含量较高。IgG和IgA自身抗体均将SLE患者分为多个亚组，其中1个亚组表现出对多种抗原的广泛反应性，3个亚组表现出不同程度的反应性，1个亚组则无反应性。这些聚类结果表明，SLE患者在自身抗体反应性上存在显著的异质性。

通路富集分析：研究还对IgG和IgA daAAb靶标进行了通路富集分析（图6C和图6D），发现大多数相关的基因本体（GO）术语涉及DNA和RNA结合，与转录和翻译功能的调控相关，且三个簇间功能有显著重叠。这表明SLE患者中存在多种自身抗体反应模式，可能与疾病的不同病理机制相关。

图6. 基于 daAAb 阳性状态和与系统性红斑狼疮特异性 IgG 和 IgA daAAb 靶点相关的富集 GO 的分层聚类

总结

本研究利用KREX蛋白芯片技术，鉴定并验证了系统性红斑狼疮（SLE）中新的IgG和IgA自身抗体，这些抗体在区分SLE患者与健康人及患有其他自身免疫性疾病（SjD 和 SSc）的个体方面表现出高特异性。其中一些抗体的特异性甚至优于现有的诊断标志物。特别是抗LIN28A抗体在IgG和IgA中均有发现，与之前的小型研究结果一致。这项研究首次探索了IgA自身抗体，为更好地理解SLE中IgA细胞反应和研究粘膜组织在疾病中的潜在作用提供了动力。这些结果在进一步验证后，有望推进基于自身抗体的SLE诊断和分子特征分析，支持个性化的治疗策略。

参考文献：

【1】Parodis I, Lagutkin D, Lindblom J, Idborg H, Beretta L, Borghi MO; PRECISESADS Clinical Consortium; Peyper JM, Barturen G, Jakobsson PJ, Alarcón-Riquelme ME, Sherina N, Nikolopoulos D. New IgG and IgA autoantibody specificities against DNA-binding and RNA-binding proteins discriminate systemic lupus erythematosus from health and non-lupus autoimmunity-could anti-LIN28A enhance precision in diagnostics? Ann Rheum Dis. 2025 May 14:S0003-4967(25)00889-1. doi: 10.1016/j.ard.2025.04.003.

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