Xenium 5K Akoya PCF助力高分文章上线!

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滤泡性淋巴瘤(FL)是第二常见的非霍奇金淋巴瘤,通常进展缓慢,但部分患者会出现早期复发甚至侵袭性转化,导致预后不良。现行的预后系统如FL国际预后指数(FLIPI)主要依赖临床病理参数,未能充分反映肿瘤微环境(TME)的复杂性,也未被用于指导治疗策略的选择。因此,探索新的生物学标志物以优化风险分层和治疗策略迫在眉睫。

 
2025年7月3日,日本筑波大学的Mamiko Sakata-Yanagimoto团队在《Cancer Cell》上发表了一项突破性研究,利用单细胞和空间多组学分析技术,揭示了滤泡性淋巴瘤中独特的T细胞亚群及其抗肿瘤机制。

 

 

文章题目:Distinct follicular T cell subsets regulate lymphoma progression and outcomes

期刊:Cancer Cell

影响因子48.8

发表时间:2025年7月

主要技术:10x单细胞转录组和Xenium 5K空间转录原位分析,Akoya PhenoCycler Fusion(28-plex)空间蛋白组学(文章缩写为PCF)

图1 研究思路

 
01

研究内容

 

一、单细胞RNA测序(scRNA-seq)与泛癌分析

研究人员首先对7例无转移淋巴结(MFLN)和6例FL样本的T细胞进行单细胞RNA测序,共鉴定出59,117个T细胞并划分为9个亚群,其中包括非TFH滤泡T细胞亚群(TFR和TFC)以及TFH、Treg、细胞毒性T细胞(Tct)等七个已知亚群。与MFLN相比,FL中TFR、TFC4和TFC8细胞的比例显著升高,且这些细胞表现出独特的多功能基因和蛋白质表达模式。随后,研究人员整合了26种癌症的30个scRNA-seq数据集,发现TFR细胞在FL中比例显著高于其他癌种,而TFC4/TFC8细胞在FL和弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中均富集,但FL中TFC4比例更高。

图2 单细胞RNA测序(scRNA-seq)与泛癌分析结果

二、空间转录组技术Xenium与多重数字空间蛋白检测(PCF)

研究人员利用Xenium空间转录组技术(Xenium Prime 5K Human Pan Tissue & Pathway Panel)对12个福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)FL样本进行原位分析,并结合PCF(28-plex 抗体组合)验证242例患者组织。结果显示,TFR细胞密集分布于肿瘤性滤泡(NF)核心区域,与恶性B细胞和TFH细胞形成紧密共定位;而TFC4/TFC8细胞则特异性聚集在NF边缘,与耗竭性T细胞(Tct-exh)共同构成“包围网”结构。通过细胞间配体-受体互作分析,证实CXCL13-CXCR5轴驱动TFR/TFC细胞向NF定向迁移,而CCL19/CCL21-CCR7轴介导TFC细胞向T细胞区迁移,形成空间互补的免疫生态位。

图3 FL中非TFH滤泡T 细胞亚群Xenium空间分析结果

图4 PCF检测的 FL中非TFH 滤泡T 细胞亚群的生态位形成

三、细胞诱导实验与功能验证

单细胞TCR测序、RNA速度分析和体外细胞诱导实验证实,FL中TFH细胞过度分泌IL-21是驱动非TFH滤泡T细胞亚群分化的核心微环境因素。TFR细胞与TFH/Treg细胞共享TCR克隆型,其分化依赖IL-21与TGF-β1协同作用,高表达IL10和TFH相关基因;TFC4细胞源自TFH,在TGF-β1作用下下调CD40L并上调CCR7/TCF1;TFC8细胞则来自Tct-rst细胞,经IL-21诱导后获得GZMM/TCF1高表达和PRDM1下调的表型。空间分析显示IL-21在TFR/TFC细胞富集区域密度显著升高,且体外添加IL-21/TGF-β1能高效诱导Treg、TFH和Tnv8细胞分别分化为诱导的TRF(i-TFR)、i-TFC4和i-TFC8细胞,由此验证了IL-21主导的微环境信号是塑造FL非TFH滤泡T细胞亚群独特表型的关键机制。

图5 非 TFH 滤泡 T 细胞亚群在 FL 中的功能

四、非TFH滤泡T细胞亚群的抗肿瘤机制

实验结果证实,TFR细胞通过高表达IL-10和PD-1等抑制性分子,显著抑制TFH细胞的活化与增殖,从而阻断其对恶性B细胞的辅助作用;TFC4/TFC8细胞则表现出更强的IFN-γ/TNF-α分泌能力及CD107a介导的脱颗粒活性,直接杀伤B细胞并诱导其凋亡,且TFC8细胞的杀伤效能优于耗竭性CD8 T细胞。此外,TFR细胞对CXCL13的趋化响应与TFC细胞对CCL19/CCL21的迁移能力差异,进一步解释了它们在肿瘤滤泡内外的空间分布特征。这些研究证实,非TFH滤泡T细胞亚群通过间接(TFR抑制TFH)与直接(TFC杀伤B细胞)的双重机制协同抑制FL进展。

图6  FL 中非 TFH 滤泡 T 细胞亚群的生态学

五、PCF(即PhenoCycler Fusion)分析非TFH滤泡T细胞亚群的预后价值

基于PCF数据的多中心回顾性队列分析发现,TFR和TFC细胞比例与24个月内疾病进展显著负相关,且TFR≥2.0%或TFC≥2.5%的患者无进展生存期(TTR)明显延长。进一步整合TFR/TFC双指标构建的“TFR/TFC分类”可独立于FLIPI风险分层预测TTR,并在不同年龄、病理分级和治疗方案的亚组中保持稳健预后价值。ROC曲线分析显示加入TFR/TFC信息后,TTR预测模型的AUC、连续净重新分类指数(NRI)和综合判别改善指数(IDI)均显著改善。总之,对非TFH滤泡T细胞亚群的定量分析在多个独立的FL队列中显示出预后意义,表明这些细胞具有抗肿瘤特性,并有可能改善淋巴瘤的风险分层。

图7 基于 PCF 的多中心预后研究

 

02
总结

本研究运用单细胞转录组、Xenium 5K空间转录原位分析以及PCF(即PhenoCycler Fusion)(28-plex抗体组合)空间蛋白等综合性高分辨率多组学技术对FL患者的滤泡T细胞进行了全面解析,揭示了蕴含异质性滤泡T细胞亚群的免疫生态系统,并阐明了其生物学机制与临床意义,为FL的免疫治疗提供了新靶点和理论依据。这一发现不仅深化了对淋巴瘤免疫微环境的理解,也为开发基于T细胞亚群的精准治疗策略奠定了基础。

 图8 研究概览

参考文献:

Abe et al., Distinct follicular T cell subsets regulate lymphoma progression and outcomes, Cancer Cell (2025), https://doi.org/10.1016/j.ccell.2025.06.013

图片来源:图片均来源于参考文献

 

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