全外显子测序服务
全外显子测序 (Whole-exome sequencing，WES)是利用探针杂交富集外显子区域的 DNA 序列，通过高通量测序，发现与蛋白质 功能变异相关突变的技术手段。虽然外显子区域不到全基因组的2%，但是却集中了大部分疾病的致病突变位点。相比于全基因组测 序，外显子组测序更加经济、高效。外显子组测序主要用于识别和研究与疾病、种群进化相关的编码区及UTR区域内的结构变异。结 合大量的公共数据库提供的外显子数据，有利于更好地解释所得变异结构之间的关联和致病机理。 云准科技采用Twist全面外显子捕获试剂盒，可靶向 36.8 Mb 的人类蛋白编码基因，覆盖 > 99% 的RefSeq、 CCDS 和 GENCODE 数据 库中的蛋白编码区域。与竞品相比，这是对最新区域的最优覆盖(图 )。
外显子测序技术优势
直接对蛋白编码序列进行测序，找出影响蛋白结构的变异
高深度测序，可发现常见变异及频率低于1%的罕见变异
仅针对外显子组区域，有效降低测序费用，储存空间和工作量
外显子测序产品应用
外显子测序技术参数
样品要求：
样品类型:DNA 样品
样品总量: ≥ 0.6 μg DNA (提取自新鲜及冻存样本) ≥ 0.8 μg DNA (提取自 FFPE 样本)
捕获平台：
Twist 全面外显子捕获试剂盒 测序平台
Illumina PE150
测序深度：
1)单基因病 / 复杂疾病有效测序深度 100X 以上
2)肿瘤有效测序深度 : 癌组织 ，200X, 癌旁组织 / 血液 样本，100X
注:可根据老师研究目的进行更高深度测序
外显子测序服务内容
样本检测 外显子捕获建库 上机测序 数据质控 SNP/InDel/CNV检测 高级信息分析
案例解析(一):疾病研究
目前，全基因组关联分析 (GWAS)是寻找疾病相关变异非常流行的一种方法。这种方法可以非常有效地在整个基因组中发现常见的疾 病变异，但缺点是可能会漏掉不太常见的外显子变异。这项研究以外显子测序为手段，分析了近5万人(40X)的蛋白质编码基因， 鉴定出与2型糖尿病相关的新型罕见变异。这一发现或有助于改进对2型糖尿病的特征鉴别和治疗。通过外显子组关联分析找出7个位 点上15个变体表现出显著关联，其中2个是过去GWAS没有发现的新变异。在基因级别上，有3个基因达到显著关联。
案例解析(二):癌症研究
前列腺癌的深度基因组学分析已经鉴定出一些复发性相关的变异基因，这些基因参与雄激素信号传导，比如DNA修复和PI3K信号传导 等基因。然而，更大规模的基因组学分析可以鉴定出一些其他低频的反复突变基因。在这篇文章中，研究人员汇总并统一分析来自 1,013个前列腺癌的外显子组测序数据。鉴定和验证了一类新的由表观遗传调节因子中的突变所定义的E26转化特异性(E26 transfor- mation-specific,ETS)-融合阴性肿瘤，以及在之前的前列腺癌研究中未涉及到的途径中的变异，如剪接体途径。同时作者还发现显著 突变基因(significantly mutated genes, SMG)的突变率遵循长尾分布，许多基因的突变率不到3%。作者总共确定了97个SMG，包 括70个在之前的研究中未报道的前列腺癌SMG，例如泛素连接酶CUL3和转录因子SPEN。最后，通过比较原发性和转移性前列腺癌中 的突变位点信息，鉴定出一组可以预测前列腺癌危险分层的基因组标记。
