MassARRAY系统是可以直接检测核酸的桌面式质谱仪。MassARRAY系统,主要是针对检测DNA靶标数量需求在十几个到几 百个位点,可实现中通量,低成本,短周期,高精准的基因分型。应用范围覆盖药物基因组学、遗传性疾病、肿瘤及液体活检、传染 性疾病等各个领域。
图 MassARRAY系统检测原理
MassARRAY系统检测基因分型的核心原理是多重PCR+单碱基延伸+质谱飞行检测,最终由于不同碱基的分子质量差,导致其在质谱飞 行的过程中,分子质量大的飞行速度慢,最后根据出峰的位置,判断碱基类型。
3.接下来,我们就可以将单碱基延伸后的产物进行纯化,然后移到SpectroCHIP芯片上,进行质谱检测。打质谱的原理如下图所示, DNA被激光照射带正电,在检测的真空管中飞行,飞行速度与各个延伸产物的质量成反比,最后通过出峰的位置,判定碱基类型,从 而实现基因分型。
图 多重PCR扩增及单碱基延伸
MassARRAY系统检测结果
MassARRAY系统的检测结果会给出直接的峰图,一目了然的判定检测靶标的基因型,结果精确,稳定。如下图所示,杂合SNP由于 G,T碱基的质量差,会产生两个峰,而纯合的SNP,就只有一个峰。我们根据不同碱基的质量差,来判定该峰的碱基类型。
MassARRAY核酸质谱送样要求
SNP检测:
DNA样本浓度为10ng/ul
DNA样本体积 准备至少5 ul
A260:280 1.8-2.0
A260:A230 2.0-2.5
MassARRAY系统主要应用领域