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         MassARRAY系统是可以直接检测核酸的桌面式质谱仪。MassARRAY系统,主要是针对检测DNA靶标数量需求在十几个到几 百个位点,可实现中通量,低成本,短周期,高精准的基因分型。应用范围覆盖药物基因组学、遗传性疾病、肿瘤及液体活检、传染 性疾病等各个领域。

图 MassARRAY系统检测原理

MassARRAY系统检测基因分型的核心原理是多重PCR+单碱基延伸+质谱飞行检测,最终由于不同碱基的分子质量差,导致其在质谱飞 行的过程中,分子质量大的飞行速度慢,最后根据出峰的位置,判断碱基类型。

1.首先,我们会通过多重PCR,扩增出含有检测靶标的DNA序列,目前我们一个孔可以最多做40重    PCR反应,即在一个孔里,我们可 以最多检测40个靶标位点。
2.随后,我们会通过iPLEX技术进行单碱基延伸,针对某一个检测靶标,由于我们的延伸引物序列是一样的,所以针对该检测靶标, 只有延伸的末端目标碱基一个碱基的差异。后续我们就是根据末端目标碱基的质量差来进行基因分型的。

3.接下来,我们就可以将单碱基延伸后的产物进行纯化,然后移到SpectroCHIP芯片上,进行质谱检测。打质谱的原理如下图所示, DNA被激光照射带正电,在检测的真空管中飞行,飞行速度与各个延伸产物的质量成反比,最后通过出峰的位置,判定碱基类型,从 而实现基因分型。

图 多重PCR扩增及单碱基延伸

MassARRAY系统检测结果

MassARRAY系统的检测结果会给出直接的峰图,一目了然的判定检测靶标的基因型,结果精确,稳定。如下图所示,杂合SNP由于 G,T碱基的质量差,会产生两个峰,而纯合的SNP,就只有一个峰。我们根据不同碱基的质量差,来判定该峰的碱基类型。

MassARRAY核酸质谱送样要求

SNP检测:

  • DNA样本浓度为10ng/ul

  • DNA样本体积 准备至少5 ul

  • A260:280 1.8-2.0

  • A260:A230 2.0-2.5

MassARRAY系统主要应用领域


 

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