目前已知RNA上存在160多种碱基修饰,N6-methyladenosine(m6A)修饰是丰度最高的一种修饰类型。近年来在医学、动植物研究中已成为热点,如肿瘤等疾病的发生发展、生长发育、植物胁迫响应等方面均有广泛研究。 然而,表观修饰在检测过程中往往存在的痛点如:样本起始量要求总RNA最少1μg以上以及实验流程繁琐耗时等,一直困扰着研究人员!
现在,云准科技基于AlidaBio EpiPlex™试剂盒为您提供全新的m6A检测服务,只需ng级别的微量RNA,并且还可以获得mRNA和Inosine的双重检测!
图.片段化的RNA由微珠混合物捕获,每种微珠展示带有独特RNA修饰条形码(Modification Barcode,MBC)的测序接头和非抗体结合子(Non-Antibody Binder,NAB)。为生成编码文库,接头通过酶促反应从微珠表面转移至被捕获的RNA。随后进行逆转录并经PCR扩增完成文库构建。最终文库结构包含正向和反向Illumina接头(分别为P5-i5-R1和P7-i7-R2)、唯一分子标识符(UMI)以及RNA MBC。通过测序可根据MBC推断RNA修饰的存在情况。
m6A甲基化检测实验流程
一箭双雕
独家「邻近条形码技术」同步检测多种RNA修饰(如m6A、Inosine),无需分次实验!
临床样本无忧
仅需20ng polyA-RNA或250ng总RNA(血液/组织/尿液/FFPE皆适用),突破肿瘤活检等珍贵样本限制!
极速高效
3小时手动操作 + 7小时全流程,比传统MeRIP快2倍!
精准之王
10倍信噪比提升,机器学习驱动分析,结果可重复性远超竞品!
一站式解决方案
从样本到报告:同步输出RNA修饰位点、丰度定量及基因表达数据,告别额外RNA-Seq!
m6A甲基化检测优势
外显子测序技术优势
m6A甲基化应用方向
*本服务仅限科研使用,不可用于临床诊断流程
图.EpiPlex m6A甲基化检测支持低RNA起始量的样本分析。尽管随着RNA起始量的降低,RNA修饰位点数量有所减少,但在典型活检样本的RNA起始量下,仍能检测到大量高质量的m6A和肌苷修饰位点。EpiPlex在低RNA起始量下也能稳定检测修饰位点,试剂盒推荐的起始量为≥250ng总RNA或≥20 ng mRNA。
图.与MeRIP相比,EpiPlex可重复性及灵敏度更高 (信噪比提升10倍)
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