Visium空间基因表达解决方案
基因表达·空间位置可视化
细胞在组织样本中相对的位置关系对于理解疾病病理学至关重要。Visium空间基因表达解决方案不仅可以检测带有空间分辨的全转录组表达,同时还可以捕获相同组织切片中的组织学信息,并且可以将基因表达谱映射回组织原始的位置。
该解决方案为癌症,免疫生理学,神经科学,发育生物学等领域的研究提供组织和基因表达复杂性的新视角。
Visium空间基因表达解决方案工作流程
用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域(6.5x6.5mm),每个捕获区域含有5000个被条形码标记的点(barcoded spots),直径为55 μm,(两点之间中心的距离为100 μm),每个点都有一个独特的条形码序列。当RNA从组织切片的细胞中释放出来后,迁移到每个点的RNA会被标记上相应的条形码序列,然后进行文库构建并进行测序。接下来,根据数据的条形码信息对数据进行分配,以确定哪些数据来自哪个位置。最终实现空间基因表达的可视化。
Visium空间基因表达解决方案送样要求
Visium空间基因表达解决方案技术优势
➤ 将空间分辨的全转录组分析与形态学背景相结合,补充单细胞基因表达在空间信息上的空白
➤ 通过绘制基因活动发生的位置,获得疾病复杂性的完整视图
➤ 通过无偏分析发现新的目标
Visium空间基因表达解决方案研究领域
新鲜冷冻的组织
(目前已经测试的物种包括:人,小鼠,大鼠)
Visium空间基因表达解决方案主要原理
Visium空间基因表达解决方案结果展示
*本服务仅限科研使用,不可用于临床诊断流程
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